Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms