Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BGRP55822 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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