Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHB3P54753 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms