Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2A2P52657 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms