Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCR4P51679 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCR4P51679 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCR4P51679 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCR4P51679 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCR4P51679 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCR4P51679 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCR4P51679 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCR4P51679 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCR4P51679 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCR4P51679 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms