Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms