Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms