Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX2P28328 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX2P28328 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX2P28328 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX2P28328 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX2P28328 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX2P28328 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX2P28328 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX2P28328 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX2P28328 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX2P28328 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX2P28328 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX2P28328 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX2P28328 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX2P28328 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX2P28328 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX2P28328 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX2P28328 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX2P28328 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX2P28328 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX2P28328 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX2P28328 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX2P28328 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX2P28328 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX2P28328 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX2P28328 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX2P28328 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX2P28328 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX2P28328 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX2P28328 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX2P28328 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms