Protein–RNA interactions for Protein: P26010

ITGB7, Integrin beta-7, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB7P26010 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB7P26010 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms