Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRGP23470 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRGP23470 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
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