Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCP2P22307 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCP2P22307 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCP2P22307 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCP2P22307 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCP2P22307 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCP2P22307 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCP2P22307 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCP2P22307 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2P22307 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCP2P22307 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCP2P22307 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCP2P22307 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCP2P22307 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCP2P22307 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCP2P22307 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCP2P22307 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2P22307 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2P22307 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2P22307 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2P22307 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2P22307 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2P22307 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2P22307 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2P22307 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2P22307 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2P22307 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2P22307 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2P22307 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2P22307 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2P22307 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2P22307 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2P22307 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2P22307 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2P22307 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2P22307 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2P22307 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2P22307 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2P22307 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2P22307 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2P22307 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2P22307 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2P22307 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2P22307 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2P22307 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2P22307 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2P22307 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2P22307 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2P22307 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2P22307 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2P22307 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2P22307 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2P22307 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2P22307 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2P22307 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2P22307 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2P22307 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2P22307 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2P22307 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2P22307 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2P22307 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2P22307 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2P22307 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2P22307 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms