Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF3P18847 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF3P18847 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF3P18847 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF3P18847 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF3P18847 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF3P18847 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF3P18847 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF3P18847 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF3P18847 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF3P18847 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATF3P18847 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATF3P18847 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATF3P18847 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF3P18847 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF3P18847 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms