Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EGR1P18146 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
EGR1P18146 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
EGR1P18146 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EGR1P18146 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EGR1P18146 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EGR1P18146 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EGR1P18146 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EGR1P18146 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EGR1P18146 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EGR1P18146 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14□□□□□ -0.17
EGR1P18146 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EGR1P18146 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EGR1P18146 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EGR1P18146 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
EGR1P18146 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EGR1P18146 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EGR1P18146 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EGR1P18146 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EGR1P18146 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EGR1P18146 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14□□□□□ -0.17
EGR1P18146 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EGR1P18146 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EGR1P18146 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EGR1P18146 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EGR1P18146 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EGR1P18146 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EGR1P18146 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EGR1P18146 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EGR1P18146 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EGR1P18146 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EGR1P18146 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EGR1P18146 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EGR1P18146 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EGR1P18146 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EGR1P18146 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EGR1P18146 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EGR1P18146 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EGR1P18146 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EGR1P18146 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EGR1P18146 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EGR1P18146 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EGR1P18146 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EGR1P18146 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EGR1P18146 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
EGR1P18146 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EGR1P18146 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EGR1P18146 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EGR1P18146 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms