Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GJA1P17302 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GJA1P17302 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJA1P17302 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GJA1P17302 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJA1P17302 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA1P17302 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA1P17302 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA1P17302 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA1P17302 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA1P17302 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA1P17302 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA1P17302 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA1P17302 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA1P17302 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA1P17302 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA1P17302 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA1P17302 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA1P17302 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA1P17302 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA1P17302 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA1P17302 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA1P17302 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA1P17302 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms