Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX4I1P13073 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms