Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHGAP10645 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHGAP10645 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHGAP10645 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHGAP10645 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHGAP10645 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHGAP10645 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHGAP10645 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHGAP10645 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHGAP10645 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHGAP10645 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHGAP10645 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHGAP10645 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHGAP10645 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHGAP10645 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHGAP10645 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHGAP10645 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHGAP10645 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHGAP10645 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHGAP10645 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHGAP10645 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHGAP10645 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHGAP10645 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHGAP10645 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHGAP10645 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHGAP10645 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHGAP10645 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHGAP10645 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHGAP10645 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHGAP10645 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHGAP10645 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHGAP10645 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHGAP10645 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHGAP10645 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHGAP10645 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHGAP10645 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHGAP10645 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHGAP10645 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHGAP10645 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHGAP10645 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHGAP10645 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHGAP10645 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHGAP10645 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHGAP10645 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHGAP10645 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHGAP10645 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHGAP10645 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHGAP10645 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHGAP10645 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHGAP10645 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHGAP10645 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHGAP10645 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHGAP10645 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHGAP10645 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHGAP10645 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHGAP10645 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHGAP10645 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHGAP10645 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHGAP10645 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHGAP10645 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHGAP10645 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHGAP10645 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHGAP10645 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHGAP10645 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHGAP10645 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHGAP10645 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHGAP10645 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHGAP10645 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHGAP10645 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHGAP10645 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHGAP10645 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHGAP10645 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHGAP10645 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHGAP10645 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHGAP10645 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHGAP10645 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHGAP10645 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHGAP10645 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHGAP10645 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHGAP10645 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHGAP10645 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHGAP10645 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHGAP10645 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHGAP10645 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHGAP10645 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHGAP10645 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHGAP10645 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHGAP10645 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHGAP10645 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHGAP10645 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHGAP10645 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHGAP10645 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHGAP10645 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHGAP10645 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHGAP10645 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHGAP10645 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHGAP10645 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHGAP10645 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHGAP10645 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHGAP10645 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms