Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PGA3P0DJD8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGA3P0DJD8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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