Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJB1P08034 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB1P08034 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB1P08034 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB1P08034 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB1P08034 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB1P08034 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB1P08034 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB1P08034 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB1P08034 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB1P08034 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB1P08034 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB1P08034 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB1P08034 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB1P08034 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB1P08034 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB1P08034 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJB1P08034 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB1P08034 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB1P08034 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms