Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPBP07199 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPBP07199 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPBP07199 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPBP07199 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPBP07199 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPBP07199 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPBP07199 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPBP07199 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPBP07199 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPBP07199 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPBP07199 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPBP07199 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPBP07199 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPBP07199 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPBP07199 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPBP07199 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPBP07199 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPBP07199 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPBP07199 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPBP07199 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPBP07199 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPBP07199 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPBP07199 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPBP07199 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPBP07199 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPBP07199 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPBP07199 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPBP07199 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPBP07199 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms