Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEFLP07196 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEFLP07196 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEFLP07196 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEFLP07196 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEFLP07196 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEFLP07196 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEFLP07196 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEFLP07196 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEFLP07196 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEFLP07196 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFLP07196 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFLP07196 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFLP07196 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFLP07196 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFLP07196 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFLP07196 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFLP07196 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFLP07196 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFLP07196 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFLP07196 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFLP07196 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFLP07196 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFLP07196 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFLP07196 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFLP07196 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFLP07196 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFLP07196 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFLP07196 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFLP07196 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEFLP07196 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms