Protein–RNA interactions for Protein: P05204

HMGN2, Non-histone chromosomal protein HMG-17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN2P05204 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN2P05204 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms