Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRATO95237 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRATO95237 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LRATO95237 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRATO95237 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRATO95237 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRATO95237 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRATO95237 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRATO95237 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRATO95237 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRATO95237 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRATO95237 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRATO95237 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRATO95237 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms