Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK1O94907 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK1O94907 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK1O94907 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK1O94907 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK1O94907 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK1O94907 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK1O94907 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK1O94907 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK1O94907 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK1O94907 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK1O94907 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK1O94907 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK1O94907 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK1O94907 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK1O94907 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK1O94907 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK1O94907 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK1O94907 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK1O94907 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK1O94907 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK1O94907 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK1O94907 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK1O94907 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK1O94907 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK1O94907 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK1O94907 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK1O94907 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK1O94907 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms