Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRMUO75648 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRMUO75648 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRMUO75648 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRMUO75648 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRMUO75648 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRMUO75648 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRMUO75648 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRMUO75648 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRMUO75648 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TRMUO75648 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRMUO75648 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRMUO75648 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRMUO75648 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRMUO75648 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRMUO75648 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRMUO75648 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms