Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms