Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GMDSO60547 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GMDSO60547 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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