Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPAG9O60271 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAG9O60271 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms