Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SLC25A20O43772 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms