Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TLX3O43711 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TLX3O43711 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLX3O43711 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms