Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCEO43556 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SGCEO43556 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCEO43556 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCEO43556 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCEO43556 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCEO43556 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SGCEO43556 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCEO43556 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCEO43556 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCEO43556 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCEO43556 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCEO43556 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCEO43556 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCEO43556 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SGCEO43556 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCEO43556 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SGCEO43556 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCEO43556 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCEO43556 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCEO43556 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SGCEO43556 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCEO43556 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCEO43556 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SGCEO43556 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCEO43556 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SGCEO43556 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SGCEO43556 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SGCEO43556 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SGCEO43556 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SGCEO43556 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SGCEO43556 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCEO43556 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SGCEO43556 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCEO43556 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCEO43556 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SGCEO43556 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SGCEO43556 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCEO43556 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCEO43556 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCEO43556 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCEO43556 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCEO43556 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCEO43556 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCEO43556 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCEO43556 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCEO43556 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCEO43556 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCEO43556 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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