Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP290O15078 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP290O15078 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP290O15078 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP290O15078 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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