Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLGNO14967 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLGNO14967 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLGNO14967 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLGNO14967 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms