Protein–RNA interactions for Protein: O14562

UBFD1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBFD1O14562 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBFD1O14562 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBFD1O14562 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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