Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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