Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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C9orf172C9J069 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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C9orf172C9J069 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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C9orf172C9J069 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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C9orf172C9J069 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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C9orf172C9J069 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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C9orf172C9J069 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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C9orf172C9J069 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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C9orf172C9J069 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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C9orf172C9J069 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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C9orf172C9J069 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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C9orf172C9J069 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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