Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf47A7E2U8 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms