Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFCAB5A4FU69 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFCAB5A4FU69 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms