Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC144AA2RUR9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms