Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
LAMC3Q9Y6N6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
LAMC3Q9Y6N6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
LAMC3Q9Y6N6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC41.92■■■■■ 4.3
LAMC3Q9Y6N6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
LAMC3Q9Y6N6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
LAMC3Q9Y6N6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
LAMC3Q9Y6N6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
LAMC3Q9Y6N6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
LAMC3Q9Y6N6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
LAMC3Q9Y6N6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.9■■■■■ 4.3
LAMC3Q9Y6N6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
LAMC3Q9Y6N6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
LAMC3Q9Y6N6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
LAMC3Q9Y6N6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
LAMC3Q9Y6N6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
LAMC3Q9Y6N6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
LAMC3Q9Y6N6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
LAMC3Q9Y6N6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
LAMC3Q9Y6N6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
LAMC3Q9Y6N6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
LAMC3Q9Y6N6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
LAMC3Q9Y6N6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
LAMC3Q9Y6N6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
LAMC3Q9Y6N6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
LAMC3Q9Y6N6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
LAMC3Q9Y6N6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
LAMC3Q9Y6N6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
LAMC3Q9Y6N6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
LAMC3Q9Y6N6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
LAMC3Q9Y6N6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
LAMC3Q9Y6N6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
LAMC3Q9Y6N6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
LAMC3Q9Y6N6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
LAMC3Q9Y6N6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
LAMC3Q9Y6N6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
LAMC3Q9Y6N6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
LAMC3Q9Y6N6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
LAMC3Q9Y6N6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
LAMC3Q9Y6N6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
LAMC3Q9Y6N6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
LAMC3Q9Y6N6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
LAMC3Q9Y6N6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
LAMC3Q9Y6N6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
LAMC3Q9Y6N6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
LAMC3Q9Y6N6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
LAMC3Q9Y6N6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
LAMC3Q9Y6N6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
LAMC3Q9Y6N6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
LAMC3Q9Y6N6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
LAMC3Q9Y6N6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
LAMC3Q9Y6N6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC41.78■■■■■ 4.28
LAMC3Q9Y6N6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.77■■■■■ 4.28
LAMC3Q9Y6N6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
LAMC3Q9Y6N6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
LAMC3Q9Y6N6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
LAMC3Q9Y6N6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
LAMC3Q9Y6N6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
LAMC3Q9Y6N6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.27
LAMC3Q9Y6N6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
LAMC3Q9Y6N6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
LAMC3Q9Y6N6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
LAMC3Q9Y6N6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
LAMC3Q9Y6N6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
LAMC3Q9Y6N6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
LAMC3Q9Y6N6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC41.73■■■■■ 4.27
LAMC3Q9Y6N6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC41.73■■■■■ 4.27
LAMC3Q9Y6N6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
LAMC3Q9Y6N6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC41.72■■■■■ 4.27
LAMC3Q9Y6N6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
LAMC3Q9Y6N6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
LAMC3Q9Y6N6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
LAMC3Q9Y6N6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
LAMC3Q9Y6N6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
LAMC3Q9Y6N6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
LAMC3Q9Y6N6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
LAMC3Q9Y6N6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
LAMC3Q9Y6N6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
LAMC3Q9Y6N6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
LAMC3Q9Y6N6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
LAMC3Q9Y6N6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
LAMC3Q9Y6N6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
LAMC3Q9Y6N6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
LAMC3Q9Y6N6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
LAMC3Q9Y6N6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
LAMC3Q9Y6N6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
LAMC3Q9Y6N6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
LAMC3Q9Y6N6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
LAMC3Q9Y6N6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
LAMC3Q9Y6N6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
LAMC3Q9Y6N6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
LAMC3Q9Y6N6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
LAMC3Q9Y6N6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
LAMC3Q9Y6N6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
LAMC3Q9Y6N6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
LAMC3Q9Y6N6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
LAMC3Q9Y6N6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
LAMC3Q9Y6N6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
LAMC3Q9Y6N6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.26
LAMC3Q9Y6N6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms