Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H6

KCNE3, Potassium voltage-gated channel subfamily E member 3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNE3Q9Y6H6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNE3Q9Y6H6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNE3Q9Y6H6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNE3Q9Y6H6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms