Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A5

TACC3, Transforming acidic coiled-coil-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TACC3Q9Y6A5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TACC3Q9Y6A5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TACC3Q9Y6A5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TACC3Q9Y6A5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms