Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4R7

TTLL3, Tubulin monoglycylase TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3Q9Y4R7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL3Q9Y4R7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL3Q9Y4R7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms