Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIF3AQ9Y2N7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
HIF3AQ9Y2N7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HIF3AQ9Y2N7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HIF3AQ9Y2N7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIF3AQ9Y2N7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HIF3AQ9Y2N7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms