Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SBNO2Q9Y2G9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SBNO2Q9Y2G9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SBNO2Q9Y2G9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms