Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC4Q9Y296 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC4Q9Y296 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC4Q9Y296 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161 ms