Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA3Q9XRX5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms