Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAPRE3Q9UPY8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAPRE3Q9UPY8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MAPRE3Q9UPY8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms