Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP22Q9UPT9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP22Q9UPT9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP22Q9UPT9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms