Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LHX6Q9UPM6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LHX6Q9UPM6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX6Q9UPM6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms