Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP18Q9UMW8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP18Q9UMW8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
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